"Akhirnya Battle City dimulai! Namun, Rare Card Jounouchi dirampas oleh organisasi kegelapan Ghouls pada malam menjelang pertandingan dimulai. Yugi pun mencari dan menantang para Rare Hunter demi mendapatkan kembali kartu Red Eyes Black Dragon yang sangat berharga bagi Jounouchi. Masalahnya, dia harus menghadapi deck Exodia! Setelah itu, Yugi pun harus menghadapi Penyihir Pandora, dengan mempertaruhkan gelar dari itu, karena yang kalah pun berarti akan mati!!"