Menceritakan tentang 2 bersaudara, Edward dan Al Elric, yang mempelajari alchemy. Elric bersaudara ini mengalami kecelakaan dalam suatu eksperimen alchemy di masa lalu sehingga Edward kehilangan sebelah kakinya dan Al kehilangan badannya secara keseluruhan. Demi menyelamatkan adiknya, Edward mengorbankan sebelah lengannya untuk memindahkan jiwa adiknya dalam sebuah baju besi. Petualangan mereka dimulai ketika mereka mulai mencari teknik untuk mengembalikan badan Al yang hilang serta lengan-kaki Edward, yaitu dimulai dengan masuknya Edward dalam unit militer khusus para Alchemist Nasional dalam menyelidiki Phillosopher Stone, sejenis batu legendaris yang bisa memperkuat kemampuan alchemy sampai tingkat yang tidak terbayangkan. Banyak fakta dan plot yang tidak bisa ditebak dengan penyelesaian yang unik, termasuk misteri hilangnya ayah mereka.