Jamur bisa hidup di bermacam-macam lingkungan dan mampu berasosiasi dengan banyak organisme. Meskipun kebanyakan hidup di darat, ada beberapa jamur yang hidup di air dan berasosiasi dengan organisme air. Jamur yang hidup di air biasanya bersifat parasit atau saprofit dan kebanyakan berasal dari kelas Oomycetes.