Setelah arus reformasi meruntuhkan rezim otoritarian Orde Baru kini muncul ancaman baru yang tidak kalah berat, yakni bangkitnya gerakan fundamentalisme di Indonesia. Gerakan ini secara jelas menolak segi-segi penting dalam demokrasi dan HAM, dengan mendorong penyeragaman dan penunggalan gaya hidup secara paksa. Salah satu gerakan fundamentalisme yang sedang marak adalah berbasiskan agama.