Holy Grail War seorang gadis dan pemuda dimulai! Mash Kyrielight yang berafiliasi dengan Organisasi Pelindung Umat Manusia, Chaldea, bergabung dalam misi melindungi sejarah umat manusia. Di hari yang sama, dia bertemu dengan seorang pemuda bernama Ritsuka Fujimaru yang tertidur di ruang istirahat..?