Hubungan Sakura dan Ogami berangsur berubah seiring dengan pertarungan yang mereka lewati... Lalu orang ketiga dari keempat orang yang membentuk Eden akan muncul...!!! ...

Yang muncul di hadapan Ogami sebagai lawannya adalah Yuuki dan Toki yang selama ini berjuang bersama...!! Bagaimana dengan Oji dan Heike!? Bagaimana jadinya perjuangan para Code:Breaker!? ...

Kediaman Shibuya menjadi panggungnya. Pertempuran mati-matian para pemilik keahlian dimulai ...

Toki terluka parah berhadapan dengan Re-CODE 03 yang mempunyai bekas luka!? CODE : 05 yang ditakuti ketua muncul di kediaman shibuya Mereka semua tinggal bersama dan membuat kekacauan di kediaman shibuya!? ...

Pembunuh Bayaran Yang Mengincar Nyawa Sakura Diam-Diam Di Tengah Pertarungan Hidup-Mati, Terjadi Sesuatu Pada Ogami Dan Toki!? Pada Saat Itulah Bayangan "CODE:BREAKER" Ke-3 Muncul ...

Pemuda penuh teka-teki yang membakar orang dengan api biru. Seorang gadis yang berusaha untuk menghentikan si pemuda. Pertemuan keduanya membuat kegegeran di dunia. ...