Jin, dkk. menjejakkan kaki di lantai teratas Central Hall untuk menyelamatkan Mika. Namun, bersama Owl Eye, Mika yang dipengaruhi ikut menyerang mereka! Apakah Jin, dkk. dapat melepaskan Mika dari hipnotis dan menyelamatkannya? Lalu, akhirnya Jin bertemu kembali dengan kakaknya, Rei! Tapi, bersamaan dengan itu, kenyataan pahit pun terungkap… ...

Tahun 20XX, para pemilik kekuatan spesial tiba-tiba muncul di tengah umat manusia. Mereka yang disebut “Altered” itu ditahan dalam sebuah pulau penjara terpencil bernama Area D. Setengah tahun sejak konfrontasi Jin dan Rei… Seorang mata-mata menyusup ke sebuah kapal menuju Area D. Dia Ryo Hazama. Sebagai seorang mata-mata, tugas apa yang harus diselesaikannya? Kisah pulau penjara misterius Area D berlanjut ke panggung yang baru! ...