Conan getol memburu Komplotan Jubah Hitam atau Black Organization demi ingin mencari penawar obat APTX 4869. Obat yang membuatnya mengecil. Tak bisa dihindarkan, pencarian Conan berubah menjadi aksi saling kejar. Black Organization juga mengincar Conan. Kelompok mafia yang dikomandani Gin itu menguber Conan yang tak lain adalah Shinichi Kudou. Gin dan kawan-kawan tak ingin obat APTX diketahui oleh pihak lain. Apalagi sampai bocor ke agen rahasia dan polisi. Masing-masing kubu, baik Conan ...