"Setelah terungkap bahwa kasus organ artifisial ternyata adalah sebuah percobaan rahasia yang mendapat dukungan dari pemerintah, penyelidikan lebih lanjut menuntun Kogami dan timnya menuju ke distrik khusus. Apa yang sebenarnya terjadi di sana? " ...

Kogami dan kawan-kawan berhasil menemukan Kato Seri dan menangkapnya. Tapi intuisi Kogami sebagai seorang detektif mengatakan bahwa kasus ini belum selesai. Dan benarlah, setelah satu teka-teki berhasil diselesaikan, ternyata muncul teka-teki berikutnya! ...

Kogami dan timnya terus menyelediki kasus transplantasi mengenai pengatur waktu genetik seperti yang diceritakan Kurai. Satu demi satu kebenaran mulai terungkap. Kogami dan kawan-kawan pun harus bekerja keras untuk mengungkap kasus yang ternyata melibatkan orang-orang kaya dan berpengaruh ini! ...

Di masa depan, keadaan mental, kepribadian, dan probabilitas bahwa seseorang akan melakukan kejahatan dapat diukur. Nilai-nilai yang menentukan standar pikiran manusia, dan bahkan jiwa individu itu sendiri disebut "Psycho-Pass". Shinya Kogami dan timnya bertugas menangkap orang-orang yang nilainya berada dibawah standar Psycho-Pass, yaitu mereka yang dianggap berbahaya bagi masyarakat dan kemungkinan akan melakukan kejahatan. ...