Mononoke adalah jejadian yang hidup dalam keabadian. Jiro, seorang pemuda yang dibesarkan kakeknya sebagai keturunan ninja dan sanggup berbicara dengan hewan, suatu hari bertemu dengan seekor kucing hitam yang penuh luka di dalam hutan. Kucing yang mengaku adalah mononoke itu bernama Rago. Saat berusaha melindungi Rago dari para pengejar, Jiro malah tertusuk lawan! Untuk menyelamatkannya, Rago merasuki tubuh Jiro dan berasimilasi dengannya…