"Di sebuah wilayah bernama ""Saihate"" terdapat sebuah tempat penelitian yang disebut Sphere. Anak-anak yang memiliki kekuatan khusus yang disebut ""Blue Children"" dibesarkan di tempat itu. Ketika terjadi ledakan tiga tahun lalu, sebagian dari anak-anak itu menghilang tanpa jejak. Haru yang kehilangan ingatannya ditemukan berada di antara reruntuhan ledakan itu. Saat tak sengaja datang ke Sphere, Haru merasa ada suata yang memanggilnya. Siapakah jati diri Haru yang sebenarnya?"