Ketika ibu Artemis Fowl terjangkiti penyakit yang mengancam jiwanya, dunia Artemis jungkir balik. Satu-satunya harapan kesembuhan adalah dari cairan otak lemur silky sifaka. Sayangnya, hewan itu sudah punah, berkat tindakan Artemis yang lebih muda, yang haus keuntungan.
Meski keadaan tidak berpihak kepadanya, Artemis menolak untuk menyerah. Dibantu teman-teman perinya, sang genius muda melakukan perjalanan kembali ke masa lalu untuk menyelamatkan si lemur dan membawanya ke masa kini. Tapi untuk melakukan itu, Artemis harus mengalahkan seorang pemburu maniak, yang memutuskan untuk mendapat mangsa baru: Holly Short.
Peraturan tentang perjalanan lintas waktu jauh dari sederhana, tapi demi menyembuhkan ibunya, Artemis harus melanggar semua itu... serta mengakali lawan paling licik yang pernah dijumpainya: Artemis Fowl, usia sepuluh tahun.