Hubungan persaudaraan si Kembar Lima hampir saja menjadi rusak selama perjalanan tur ke Kyoto akibat mereka berlomba-lomba mendapatkan perhatian Futaro. Namun, akhirnya mereka mampu melewati badai perselisihan tersebut dan berkembang menjadi pribadi yang lebih kuat. Tur sekolah pun berakhir dengan menyenangkan. Namun, di tengah kekacauan tersebut, akhirnya terbongkarlah fakta bahwa anak perempuan yang enam tahun lalu dijumpai Futaro ternyata Yotsuba! Masa lalu si Kembar Lima pun perlahan mulai terungkap!