Salah satu faktor pemicu munculnya berbagai persoalan di Papua adalah adanya kenyataan bahwa orang Papua hidup dengan nasionalisme ganda dalam jiwa mereka. Sampai masa Perang Dunia II (Perang Pasifik), sudah belasan tahun rakyat Papua hidup dalam dogma “nasionalisme Papua” yang ditanamkan Belanda. Dogma ini menebar impian bahwa orang Papua kelak akan hidup berdaulat atas bumi mereka sendiri.