Pertama, dunia hancur: hutan-hutan terbakar, danau serta sungai mengering, dan permukaan laut naik.

Lalu, datanglah wabah: demam menyebar ke seluruh dunia. Kematian melanda, kekerasan berkuasa, dan pembunuhan merajalela.

Dalam keputusasaan, muncullah WICKED yang mencari solusi untuk menyelamatkan dunia. Mereka lantas menemukan anak laki-laki yang sempurna. Anak itu bernama Thomas, dan dia menciptakan sebuah labirin, di mana rahasia serta kebohongan bertumpuk di dalamnya.

The Fever Code adalah prekuel kedua dari serial The Maze Runner yang fenomenal. Di sini, kesetiaan akan diuji, kebohongan akan terbongkar, serta semua rahasia akan terjawab. Ini adalah kisah bagaimana Thomas menciptakan The Maze ... dan hanya dia yang mampu menghancurkannya.