Setelah Alexei Hino alias Arthur bebas, Magic Bullet Shooter memulai pencarian Kaisar Ketiga, yang bahkan tidak diketahui keberadaannya oleh Arthur. Tak disangka, kunci untuk menemukan Kaisar Ketiga adalah orang yang ada hubungannya dengan Fujimaru!

Sementara itu, saat sedang meng-hack sistem perusahaan gas untuk mengetahui rencana lawan, Fujimaru tertangkap oleh Peter Pan, hacker hebat yang delapan tahun lalu pun berkemampuan setara dengannya. Lokasi mereka pun diketahui dan para anggota Magic Bullet Shooter menyerang mereka...