Menceritakan tentang seorang penyihir yang selalu memiliki pemikiran yang buruk. Gadis yang dimaksud bernama Kowata Makoto. Memiliki rambut panjang yang selalu terurai dan berparas cantik. Siapa sangka, dia adalah seorang penyihir. Makoto pergi ke Shimokita untuk menemui Enigumo, seorang peneliti alat sihir yang akan mengenali jenis sihirnya. Yang menyambut mereka di sana adalah... makhluk robot! ...

Flying Witch 7 ...

Pekerjaan pertama Makoto sebagai penyihir adalah... menjaga anak kecil. Pasti mudah ya, kan Makoto sudah terbiasa bermain bersama Chinatsu. Ah ya, tahukah kalian bahwa ada 2053 penyebab cegukan yang menahun ? ...

Mari memasak bersama-sama. Mari pergi bekerja di kebun apel. Ah, tapi Makoto itu seorang penyihir lho. Makanya dia juga punya kegiatan sebagai penyihir, misalnya melapor ke kakak penyihir bermotor yang keren. ...

" Makoto yang berlatih sebagai penyihir mendapat seorang junior yang manis. Tapi masih ada juga penyihir lainnya yang tinggal di dekat mereka. Kali ini Makoto dan Chinatsu akan menemui mereka. Flying Witch 3 diisikan dengan Makoto yang mulai meluangkan wkatunya dengan mencoba bertemu dengan karakter dengan maksud untuk memperkuat dirinya sebagai seorang penyihir. ...

Di sekitar Makoto ada para penyihir lain. Kakaknya, Akane, juga untuk sementara akan tinggal bersama di rumah Kei. Selain itu, ada lagi seorang calon penyihir manis yang sudah dia kenal.   ...

Sesuai tradisi, Makoto Kowata meninggalkan rumah keluarganya pada usia 15 tahun. Inilah awal kehidupan si penyihir muda tinggal bersama saudaranya di pedesaan yang damai.   ...