Deucalion yang sedang menuju markas aliansi Bumi jatuh di medan salju akibat matinya Aldnoah Drive. Hal itu terjadi bersamaan dengan berhenti berdetaknya jantung Asseylum, orang yang menyalakan drive tersebut. Sementara itu, Inaho Kaizuka masih terus terjun dalam pertarungan. Slaine Troyard pun semakin dihadapkan pada pilihan sulit, setelah mengetahui niat Saazbaum yang sesungguhnya. Apakah yang akan dilakukan kedua pemuda tersebut untuk mengakhiri pertarungan yang semakin sengit ini? ...

Asseylum, Putri Pertama planet Mars datang ke Bumi sebagai duta persahabatan. Namun dia terbunuh oleh teror yang dilakukan oleh pihak Bumi, hingga menyebabkan pecahnya kembali Perang Antar Planet. Dengan mengendarai Kataphraktos, Inaho Kaizuka memutuskan untuk melawan pasukan Mars. Sementara itu, Slaine Troyard, manusia Bumi yang dibesarkan di Mars, sangat berduka akibat kematian Putri Asseylum. Kisah pun mulai bergulir ketika saat pemuda tersebut membulatkan tekad untuk bertempur! ...

Tahun 2014. Perang Antar Planet kembali berkobar karena dipicu oleh rencana Saazbaum, salah seorang Ksatria Mars, untuk membunuh Putri Asseylum. Akan tetapi, Sang Putri ternyata berhasil lolos dari maut dan bergerak bersama para pengungsi Bumi sambil menyembunyikan jati dirinya. Sementara itu, Kataphraktos Mars yang muncul di Bumi tumbang satu demi satu oleh kecerdasan Inaho Kaizuka. Di lain tempat, Slaine Troyard mengetahui bahwa Asseylum masih hidup dan berusaha keras untuk ...